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云序生物 | 2021年客户m6A项目文章汇总
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2022-02-14 14:35
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2021年云序生物用户共有27篇m6A文章发表,其中10分以上文章6篇,5分-10分文章13篇,共占70%比重,可见m6A方向还是目前发5分以上好文章的一个重要热点方向,2021年云序发表的27篇m6A文章涉及肿瘤、代谢、神经、炎症等多个研究方向,以及人、大鼠、小鼠、鸡、牛、等多个物种。小编带大家快速浏览这27篇文章的概况:

1.FBW7通过靶向N6-甲基腺苷结合蛋白YTHDF2抑制卵巢癌的发生

FBW7 suppresses ovarian cancer development by targeting the N6-methyladenosine binding protein YTHDF2

发表期刊:Molecular Cancer

影响因子:27.401

作者单位:复旦大学附属肿瘤医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:人

疾病:卵巢癌

样品:卵巢癌细胞系

分组:敲降YTHDF2与对照

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2.YTHDF1通过MAGED1的翻译控制调节肺动脉高压

YTHDF1 Regulates Pulmonary Hypertension through Translational Control of MAGED1

发表期刊:American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine

影响因子:21.405

作者单位:南京医科大学

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq、RIP-seq

物种:小鼠

疾病:肺动脉高压

样品:肺组织

分组:Su/Hx诱发肺动脉高压与对照 1v1

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3.YTHDF2的SUMO化通过增加其与m6A修饰的mRNAs的结合亲和力促进mRNA降解和癌症进展

SUMOylation of YTHDF2 promotes mRNA degradation and cancer progression by increasing its binding affinity with m6A-modified mRNAs

发表期刊:Nucleic Acids Research

影响因子:16.971

作者单位:上海交通大学医学院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq、RIP-seq

物种:人

疾病:肺癌

样品:肺癌细胞

分组:YTHDF2-WT与K571R 1v1

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4.RNA m6A甲基化通过巨噬细胞重编程协调癌症生长和转移

RNA m6A methylation orchestrates cancer growth and metastasis via macrophage reprogramming

发表期刊:Nature Communications

影响因子:14.919

作者单位:空军军医大学

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:人

疾病:巨噬细胞重编程

样品:巨噬细胞

分组:METTL3敲降与WT 2v2

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5.METTL3通过降低APC mRNA N6-甲基腺苷依赖性YTHDF结合介导的APC表达促进肿瘤发展

METTL3 promotes tumour development by decreasing APC expression mediated by APC mRNA N6-methyladenosine-dependent YTHDF binding

发表期刊:Nature Communications

影响因子:14.919

作者单位:中国医学院肿瘤医院

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物种:小鼠

疾病:食管鳞状上皮细胞癌

样品:人食管鳞癌细胞

分组:METTL3敲降与对照 1v1

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6.m6A脱甲基酶ALKBH5的缺失通过WNT5A转录后稳定促进缺血后血管生成

Loss of m6A demethylase ALKBH5 promotes post-ischemic angiogenesis via post-transcriptional stabilization of WNT5A

发表期刊:Clinical And Translational Medicine

影响因子:11.492

作者单位:复旦大学附属中山医院

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物种:大鼠

疾病:缺血性疾病

样品:心肌微血管内皮细胞

分组:ALKBH5敲降与WT

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7.颗粒细胞m6A mRNA去甲基化酶FTO延缓FOS依赖性卵巢衰老

The m6A mRNA demethylase FTO in granulosa cells retards FOS-dependent ovarian aging

发表期刊:Cell Death & Disease

影响因子:8.469

作者单位:海军军医大学

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物种:人

疾病:卵巢衰老

样品:人卵巢颗粒细胞

分组:FTO敲降与对照 3v3

8.WNT/β-catenin抑制FTO表达增加c-Myc mRNA的m6A以促进肿瘤细胞糖酵解和肿瘤发生

WNT/β-catenin-suppressed FTO expression increases m6A of c-Myc mRNA to promote tumor cell glycolysis and tumorigenesis

发表期刊:Cell Death & Disease

影响因子:8.469

作者单位:中国医学院肿瘤医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:人

疾病:肺腺癌

样品:非小细胞肺癌细胞

分组:FTO敲降与对照 1v1

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9.猪精子发生过程中m6A mRNA甲基化的转录组动力学

Transcriptome-wide Dynamics of m6A mRNA Methylation During Porcine Spermatogenesis

发表期刊:Genomics,Proteomics&Bioinformatics

影响因子:7.69

作者单位:西北农林科技大学

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq、LC-MS/MS

物种:猪

模型:精子形成

样品:猪精细胞

分组:精原细胞、精母细胞、圆形精子 3v3v3

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10.m6A RNA修饰调节增生性瘢痕中的基因表达和纤维化相关途径

The m6A RNA Modification Modulates Gene Expression and Fibrosis-Related Pathways in Hypertrophic Scar

发表期刊:Frontiers in Cell and Developmental Biology

影响因子:6.684

作者单位:无锡中西医结合医院

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物种:人

疾病:增生性瘢痕

样品:增生性瘢痕组织

分组:增生性瘢痕组织与正常组织 3v3

11.RNA N6-甲基腺苷甲基化的分析揭示了m6A在鸡脂肪沉积中的关键作用

Profiling of RNA N6 -Methyladenosine Methylation Reveals the Critical Role of m6A in Chicken Adipose Deposition

发表期刊:Frontiers in Cell and Developmental Biology

影响因子:6.684

作者单位:农业部鸡遗传育种重点实验室

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:鸡

模型:脂肪沉淀

样品:腹壁组织

分组:肥禽与瘦禽 3v3

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12.IL-37通过调节m6A甲基化赋予抗肿瘤活性

IL-37 Confers Anti-Tumor Activity by Regulation of m6A Methylation

发表期刊:Frontiers in Oncology

影响因子:6.244

作者单位:青岛市中心医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:人

疾病:肺癌

样品:肝癌细胞系

分组:IL-37处理与对照 2v2

13.大肠杆菌处理的牛乳腺上皮细胞m6A mRNA修饰的转录组分析

Transcriptome Profiling of m6A mRNA Modification in Bovine Mammary Epithelial Cells Treated with Escherichia coli

发表期刊:International Journal of Molecular Sciences

影响因子:5.923

作者单位:华中农业大学

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物种:牛

疾病:奶牛乳腺炎

样品:MAC-T细胞

分组:Ecoli处理与对照 3v3

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14.重症急性胰腺炎小鼠模型中N6-甲基腺苷环状RNA的全基因组图谱鉴定

Genome-wide map of N6-methyladenosine circular RNAs identified in mice model of severe acute pancreatitis

发表期刊:World Journal of Gastroenterol

影响因子:5.742

作者单位:四川省西战区总医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:小鼠

疾病:重症急性胰腺炎

样品:胰腺组织

分组:重症急性胰腺炎与对照 3v3

15.m6A mRNA甲基化调控中国汉族妇女妊娠期糖尿病的发生

m6A mRNA methylation regulates the development of gestational diabetes mellitus in Han Chinese women

发表期刊:Genomics

影响因子:5.736

作者单位:济南妇幼保健院

云序生物提供的服务产品:m6A 比色法检测整体甲基化水平

物种:人

疾病:妊娠期糖尿病

样品:胎盘组织

分组:妊娠期糖尿病与对照 4v4

16.大肠癌中lncRNAs N6-甲基腺苷修饰的综合分析

Comprehensive analysis of lncRNAs N6-methyladenosine modification in colorectal cancer

发表期刊:Aging-us

影响因子:5.682

作者单位:成都医学院附属医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:人

疾病:结直肠癌

样品:结直肠癌组织

分组:肿瘤与癌旁 5v5

17.可卡因条件下小鼠海马体差异m6A-RNA的综合分析

Comprehensive Analysis of Differential m6A RNA Methylomes in the Hippocampus of Cocaine-Conditioned Mice

发表期刊:Molecular Neurobiology

影响因子:5.59

作者单位:四川大学

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:小鼠

模型:可卡因诱导小鼠条件性位置偏爱

样品:小鼠海马体

分组:可卡因处理与对照

18.果糖诱导的非酒精性脂肪肝中N6甲基腺苷甲基化修饰的分析

Analysis of N6-Methyladenosine Methylation Modification in Fructose-Induced Non-Alcoholic Fatty Liver Disease

发表期刊:Frontiers in Endocrinology

影响因子:5.555

作者单位:上海交通大学附属第一人民医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:小鼠

疾病:非酒精性脂肪肝

样品:肝组织

分组:果糖诱导的非酒精性脂肪肝与对照 4v4

19.胶质母细胞瘤中环状RNA的N6-甲基腺苷修饰的鉴定和表征

Identification and characterization of N6-methyladenosine modification of circRNAs in glioblastoma

发表期刊:JournalofCellularandMolecularMedicine

影响因子:5.31

作者单位:河北大学附属医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:人

疾病:胶质瘤

样品:胶质瘤组织

分组:胶质瘤组织与正常大脑皮质组织 5v5

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20.冠心病转录组m6A甲基化谱

Transcriptome-wide N6-methyladenosine methylation landscape of coronary artery disease

发表期刊:Epigenomics

影响因子:4.778

作者单位:中国医学科学院阜外医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:人

疾病:冠状动脉疾病

样品:外周血

分组:冠状动脉疾病与对照 5v5

21.周围神经损伤后m6A甲基化表观转录组学分析

Epitranscriptomic Analysis of m6A Methylome After Peripheral Nerve Injury

发表期刊:Frontiers in Genetics

影响因子:4.599

作者单位:天津医科大学总医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:大鼠

疾病:坐骨神经损伤

样品:坐骨神经组织

分组:坐骨神经损伤与对照 3v3

22.外伤性视神经病变后大鼠视网膜M6A甲基化表达谱的变化

The Alteration of M6A-Tagged Transcript Profiles in the Retina of Rats After Traumatic Optic Neuropathy

发表期刊:Frontiers in Genetics

影响因子:4.599

作者单位:上海长征医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:大鼠

疾病:外伤性视神经病变

样品:视网膜组织

分组:外伤性视神经病变与对照 3v3

23.感染马立克氏病病毒培养细胞中N6-甲基腺苷修饰环状RNA转录组的综合分析

Comprehensive profiling analysis of the N6-methyladenosine-modified circular RNA transcriptome in cultured cells infected with Marek's disease virus

发表期刊:Scientific Reports

影响因子:4.379

作者单位:河南农业大学

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:鸡

疾病:鸡马立克氏病毒感染

样品:鸡胚成纤维细胞

分组:感染MDV与未感染 3v3

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24.先兆子痫患者的circRNA N6-甲基腺苷甲基化及N6-甲基腺苷修饰的CircPAPPA2在滋养层侵袭中的潜在作用

circRNA N6-methyladenosine methylation in preeclampsia and the potential role of N6-methyladenosine-modified circPAPPA2 in trophoblast invasion

发表期刊:Scientific Reports

影响因子:4.379

作者单位:广东医科大学深圳龙华中心医院

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:人

疾病:子痫前期

样品:妊娠胎盘组织

分组:子痫前期和正常对照 3v3

25.镉暴露后C-myc促进大鼠卵巢颗粒细胞miR-92a-2-5p转录

C-myc promotes miR-92a-2-5p transcription in rat ovarian granulosa cells after cadmium exposure

发表期刊:Toxicology and Applied Pharmacology

影响因子:4.219

作者单位:福建医科大学

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-qPCR

物种:大鼠

模型:镉处理

样品:卵巢颗粒细胞

分组:5浓度*3重复

26.转录组m6A分析揭示猪精子在冷冻保存过程中的mRNA转录后修饰

Transcriptome-wide m6A profiling reveals mRNA post-transcriptional modification of boar sperm during cryopreservation

发表期刊:BMC Genomics

影响因子:3.969

作者单位:四川农业大学

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:猪

样品:猪精液

分组:新鲜与冻融的猪精子 3v3

27.马立克氏病病毒体外复制过程中长非编码RNA的转录组N6甲基腺苷修饰谱

Transcriptome-wide N6-methyladenosine modification profiling of long non-coding RNAs during replication of Marek's disease virus in vitro

发表期刊:BMC Genomics

影响因子:3.969

作者单位:河南农业大学

云序生物提供的服务产品:m6A MeRIP-seq、RNA-seq

物种:鸡

疾病:鸡马立克氏病毒感染

样品:鸡胚成纤维细胞

分组:感染MDV与未感染 3v3

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云序生物m6A修饰研究五大模块

01 m6A RNA修饰测序

m6A RNA修饰测序(m6A-MeRIP-seq)

对m6A RNA甲基化,目前最流行的检测手段为m6A-Seq技术,适用

于m6A RNA甲基化谱研究,快速筛选m6A RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m6A测序:

ü m6A 全转录组测序(涵盖mRNA,LncRNA,circRNA)

ü m6A  LncRNA测序(涵盖LncRNA和mRNA)

ü m6A  Pri-miRNA测序(涵盖Pri-miRNA和mRNA)

ü m6A  mRNA测序

ü m6A  miRNA测序

02 检测整体m6A RNA修饰水平

LC-MS/MS检测整体RNA修饰水平

精准高效,可以实现一次检测,9类修饰水平检测,一步到位。

比色法检测整体RNA修饰水平

快速检测m6A整体甲基化水平

03m6A RNA修饰上游酶的筛选

m6A RNA修饰相关酶PCR芯片

寻找上游直接调控m6A RNA甲基化的甲基转移酶。

04 m6A RNA修饰靶基因验证

MeRIP-qPCR

云序提供各类不同修饰的meRIP-qPCR服务,可针对mRNA,lncRNA,环状RNA等不同类型的RNA分子进行检测,低通量验证RNA修饰靶基因表达水平。

05机制互作研究

RIP-seq/qPCR

筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制。

RNA pull down -MS/WB

筛选或验证目标RNA互作基因或蛋白,研究相应的分子调控机制。

双荧光素酶实验

验证两基因互作,研究相应的分子调控机制。

ChIP-seq

筛选或验证目标蛋白与DNA互作,研究相应的分子调控机制。

云序生物服务优势

优势一:发表10分以上文章最多的m6A RNA甲基化测序服务平台。云序已累计支持客户发表57篇高水平RNA修饰文章,合计影响因子520分+,是国内支持发文最多、累计影响因子最高的公司。

优势二:至今完成4000+例 m6A测序样本,全面覆盖医口、农口等各类样本。

优势三:全面检测mRNA和各类非编码RNA(circRNA,lncRNA,Pri-miRNA等)。

优势四:独家提供m6A一站式服务:m6A整体水平检测m6A测序MeRIP-qPCR验证、RIPRNA pull-down等。

优势五:率先研发超微量MeRIP测序技术,RNA量低至500ng起。

优势六:国内最全的RNA修饰测序平台,提供m6A、m5C、m1A、m7G、m3C、m6Am、O8G、ac4C乙酰化和2'-O-甲基化测序。

云序客户RNA修饰部分文章列表

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1区 IF: 21|云序MeRIP-Seq & RIP-Seq助力肺动脉高压中m6A阅读蛋白YTHDF1机制研究

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项目文章|赫捷院士团队揭密肺腺癌 m6A 机制再次登上Nature 子刊!

项目文章|赫捷院士团队nature子刊揭示METTL3以m6A依赖方式调控食管鳞癌

农口方向3个月内搞定5分文章秘籍——m6A热点错不了

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